Prenant place sur un bateau qui les conduit à un important événement musical, les Chipmunks et les Chipettes multiplient les mauvais coups. Malgré les nombreux avertissements de Dave, Alvin continue à mettre ses proches dans le pétrin. Après une farce qui tourne mal, tout ce beau monde se retrouve à l'eau, dérivant vers une île perdue. Il n'en faudra pas plus pour souder ce groupe qui a besoin de l'apport de chacun de ses membres pour survivre. Le lieu n'est peut-être pas aussi tranquille qu'il le laisse paraître, et il y aurait même un trésor caché quelque part...
