Sous l'empire, nous retrouvons nos héros, six mois après le combat sur Malachor. Ezra a grandi et Kanan est devenu aveugle. Ils essayent tous ensemble de faire grandir la rébellion dans la galaxie, tout en faisant face à l'Empire (notamment le Grand Amiral Thrawn) et à des conflits entre les Mandaloriens. C'est ainsi qu'ils espèrent retrouver Ahsoka, disparue lors de son combat contre Dark Vador
